两万吨制药废水二沉池出水进入一级臭氧反应池，出水通过进入一级生物炭池；一级生物炭出水经提升泵进入二级臭氧反应池，出水进入二级生物炭池；出水自流进入清水池，通过提升泵排至中水池。